시스템마이크로바이옴실험실

시스템마이크로바이옴실험실

지도교수 : 서영수 교수님
홈페이지 : http://yseo.pusan.ac.kr
연구실 위치 : 첨단과학관 707호
연구실 전화 : 051-510-2267

연구활동

미생물의 오믹스(Omics) 연구

미생물 유전체 해독과 분석을 통한 생리학적 특성규명 연구
미생물 Microarray와 RNAseq의 전사체학 연구를 통한 유전자 기능 연구
Interactome 분석을 통한 signal pathways 연구

종간 생물학(Interspecies biology

- 미생물과 식물 그리고 미생물과 미생물 상호간의 상호작용) 연구

미생물과 식물의 상호작용 연구 - 식물 병원성과 면역기작
미생물 제어 및 촉진 연구 - 미생물이 생산하는 대사산물의 작용과 기주에 대한 영향

세부 연구 내용

비교유전체학을 기반으로 하여 광범위한 기주를 보유하는 Burkholderia속의 기주와 환경 특이적인 적응 양상을 규명하고자 한 연구

Young-Su Seo, Jae Yun Lim, Jungwook Park, Sunyoung Kim, Hyun-Hee Lee, Hoon Cheong, Sang-Mok Kim, Jae Sun Moon and Ingyu Hwang
Comparative genome analysis of rice-pathogenic Burkholderia provides insight into capacity to adapt to different environments and hosts.
BMC Genomics (2015)

식물병원성 곰팡이 Fusarium속이 생산하는 독소에 대한 세균의 반응을 전사체 분석을 통해 예측하고, 동식물에게 치명적인 이 독소의 탐지를 위한 biosensor로써의 개발 가능성을 제시

Jungwook Park, Hyun-Hee Lee, Kihoon Youn, Sunyoung Kim, Boknam Jung,Jungkwan Lee, Young-Su Seo
Transcriptome analyses to understand effects of the Fusarium deoxynivalenol and nivalenol mycotoxins on Escherichia coli.
Journal of Biotechnology (2014)

대표적인 벼병원균인 Burkholderia glumae을 이용하여 기주인 벼에 감염했을 시에 나타나는 유전자들의 발현 양상을 전사체 분석을 통해 연구

Sunyoung Kim, Jungwook Park, Jongyun Lee, Dongjin Shin, Dong-Soo Park, Jong-Sung Lim, Ik-Young Choi, Young-Su Seo
Understanding pathogenic Burkholderia glumae metabolic and signaling pathways within rice tissues through in vivo transcriptome analyses.
Gene (2014)

최근 5년간 국내외 학술대회 참여 현황

2014. 6. 25 한국미생물생명공학회, 대한민국,
2014년 국제학술대회 및 정기학술대회
A Rapid and Efficient Method for Construction of an Infectious Clone of Tomato Yellow Leaf Curl Virus
2014. 10. 22 한국식물병리학회, 대한민국
3rd Korea-Japan Joint Symposium & The 2014 KSPP Fall Meeting on Plant Pathology
Quorum sensing-dependent gene expression profiling in Burkholderia gladioli BSR3
2014. 11. 6 FEMS(Federation of European Microbiological Societies), 네덜란드
The 6th Congress of European Microbiologists (FEMS 2015 Congress)
Transcriptome analyses to understand infection mechanism of Burkholderia glumae in two different infection sites of rice
2015. 6. 24 한국미생물생명공학회, 대한민국,
2015년 국제학술대회 및 정기학술대회
Fusarium Mycotoxin-responsive Genes in Escherichia coli